《2001太空漫游》后9年，前国家航天委员会主任弗洛伊德博士（罗伊?谢德 Roy Scheider 饰）接受苏美合作计划，带领发现号航天站设计者科脑博士（约翰?利思戈 John Lithgow 饰）和HAL9000电脑的创始人钱德拉博士（鲍勃?巴拉班 Bob Balaban 饰）登录木星附近的苏联航空站，与苏联宇航员卡布珂（海伦?米伦 Helen Mirren 饰）等合作，空中接轨美国发现号航天站...
中世纪，一个修道院发生了一起教士莫名死亡的事件，修道院的主教遂邀请了异地的名声极好的教士William von Baskerville（肖恩·康纳利 Sean Connery 饰）和他的助手Novize Adson von Melk（克里斯汀·史莱特 Christian Slater 饰）来到修道院调查案件。William在调查中，发现他遭到了许多无形的阻挠和他人的警告，他隐约感觉到这个修道院背后...